EC物流とは？仕組みや課題と改善方法を解説

EC物流について詳しく解説します。

執筆： Shopify Japan2026年6月1日 • 読了時間： 2 分

EC事業において、物流の最適化は欠かせない要素です。ECサイトで商品を購入した顧客が最初に体験するのは、商品そのものではなく「配送サービス体験」だからです。届くまでの日数、梱包の丁寧さ、トラブル時の対応はすべてEC物流の業務であり、顧客満足度に直結します。

この記事では、EC物流の基本的な流れから課題、改善方法まで解説します。物流体制を見直したい企業はぜひ参考にしてください。

EC物流とは

EC物流とは、ECにおける商品の入荷、梱包、発送から返品対応までの一連のプロセスを指します。オーダーフルフィルメントとも呼ばれます。ECでは不特定多数の個人から注文が入るため、1件あたりの注文数量が少ない小口配送が多い点が特徴です。

1. 入荷・検品

卸売業者やメーカーなどの仕入先から商品を入荷したら、種類、数量、破損の有無を確認する検品作業を行います。取扱商品数や入荷頻度が増えるほどミスが起きやすくなるため、確実で丁寧な作業が求められます。

2. 保管（棚入れ）

検品後、所定の棚へ商品を保管します。出荷時に商品を探す時間を短縮するため、動線を意識して配置することが重要です。たとえば、古い商品を手前に配置し、人気商品を取り出しやすい位置に置くといった工夫が挙げられます。

3. 管理（棚卸し）

棚卸しとは、商品の在庫状況や品質を確認する作業です。月次や四半期ごとなど、定期的に実施されることが多く、主に以下のような項目をチェックします。

帳簿上の在庫数と一致しているか
使用期限が近い商品はないか
商品の劣化や損傷がないか

正確な在庫管理は、経営状況の把握にも重要です。在庫は経費ではなく資産として計上されますが、現金としてすぐに使えるわけではありません。在庫が過剰に増えすぎると資金の流動性が下がり、仕入れ代金の支払いや急な出費に対応できなくなるリスクがあります。棚卸しの結果をもとに、次回の仕入れ量やキャッシュフローを見直すことができます。

4. ピッキング・流通加工

顧客から注文が入ると、注文内容や出荷指示書に従い、倉庫や保管場所から対象商品を取り出します。この作業をピッキングと呼びます。主に以下の3つの方式があります。

シングルピッキング：1件の注文ごとに商品を集める方式
トータルピッキング：複数の注文に含まれる同じ商品をまとめて取り出し、あとで配送先ごとに仕分ける方式
マルチオーダーピッキング：1回の移動で複数の注文を仕分けながらまとめて回収する方式

ピッキングとあわせて、ラッピング、ラベル貼り、ネーム入れなどの流通加工を行うこともあります。商品の付加価値を高めたり、他社商品と差別化する効果があります。また、梱包や同梱物を工夫して開封体験を演出することで、顧客がSNSに開封動画を投稿するケースもあり、ブランド認知の拡大につながります。

5. 梱包・出荷

商品を梱包して配送ラベルを作成し、配送業者へ引き渡します。顧客は注文した商品をできるだけ早く受け取りたいと考えるため、配送スピードは顧客満足度に直結します。発送予定は、できる限り最短になるよう努めることが重要です。

商品の特性に合った資材の選定も重要な業務です。たとえば、食器を送る場合、破損リスクを防ぐため、各商品をプチプチで包み、食器同士がぶつからないよう仕切り材で固定し、配送用のダンボール箱に梱包します。

また、送料は荷物の重量やサイズによって決まるため、商品サイズに合わせた梱包を行い、送料を削減します。

6. 顧客対応

顧客からの問い合わせやクレームへの対応もEC物流の一部です。顧客対応の質がショップの信頼性やブランドイメージに直結するため、迅速かつ丁寧な初動対応が求められます。

また、返品、商品の交換、配送遅延などに関するポリシーの策定と、それをECサイトへ掲載することも業務の一部です。あらかじめポリシーを顧客に周知しておくことで、認識のズレによるトラブルを未然に防ぐことができます。

物流管理の種類

物流代行
自社物流
ドロップシッピング
モール一体型

1. 物流代行

物流代行は、物流業務を第三者の専門業者に委託する方法です。受注から出荷までに特化したフルフィルメントサービスをはじめ、輸送ルートの管理や在庫計画のコンサルティングなども担う3PL（サードパーティロジスティクス）などがあります。

物流代行業者の多くは、フルフィルメントセンターで業務を行っています。これらは主要な人口密集地や交通ハブの近くに配置されていることも多く、これにより迅速な配送が可能です。また、ECサイトとシステムが連携し、注文処理、在庫数の自動更新、ピッキングまで一括で管理します。

ただし、自社で物流業務を担っている場合に比べて、急な注文変更や納期調整などへの対応は、コミュニケーションに時間がかかる可能性があります。また、災害やシステムトラブルなどの緊急時の対応についても確認が必要です。

2. 自社物流

自社倉庫と専任スタッフで物流を管理する方法です。入荷から出荷まで全工程を社内で完結させるため、梱包品質や配送スピードを自社でコントロールできます。

ただし、在庫管理や梱包、出荷などの物流業務を効率的に行うには、ECサイトの運営、商品開発、マーケティングとは異なるノウハウが必要です。

3. ドロップシッピング

ドロップシッピングとは、自社で在庫を持たずに販売する方法です。顧客から注文が入ると、メーカーや卸業者が直接顧客へ商品を発送するため、倉庫や物流設備が不要で、在庫リスクや初期コストを抑えられます。

ただし、発送はメーカーや卸業者が行うため、梱包品質や配送スピードを自社でコントロールすることができません。また、配送遅延や梱包の不備があった場合でも、顧客からの問い合わせやクレームは販売元である自社へ届くため、取引先との連携と信頼関係の構築が重要です。

4. モール一体型物流

Amazon（アマゾン）のFBA（フルフィルメントbyアマゾン）や、楽天市場のRSL（楽天スーパーロジスティクス）など、ECモールが提供する物流サービスを利用する方法です。出店しているモールの倉庫へ商品を預けることで、注文処理から配送までをモール側が代行します。

自社ECサイトや他モールからの注文にも対応できるマルチチャネルサービスを提供している事業者も多く、複数の販売チャネルの物流を一元管理できるのが大きなメリットです。ただし、メインのモール以外のチャネルからの注文には、手数料などの料金が別途発生する場合があります。

また、出店と物流を同一のモールに依存すると、モールの規約変更や手数料改定の影響を受けやすくなる点にも注意が必要です。

EC物流の5つの課題

ヒューマンエラー
人手不足
物流コストの増加
短納期による負担
個人情報の取り扱い

1. ヒューマンエラー

EC物流は工程が多いうえ、多様な商品や注文に対応する必要があるため、ヒューマンエラーが発生しやすい環境にあります。よくあるミスは以下の通りです。

ピッキング時に商品の種類や数を間違える
検品ミスで不具合のある商品を出荷してしまう
宛名ラベルの貼り間違いによる誤配送が発生する
在庫数の入力間違いで実在庫と帳簿上の数がズレる

物流におけるミスが特に厄介なのは、一度出荷してしまうと修正が難しい点です。たとえば、誤った商品を顧客へ送付した場合、必ずしもスムーズに回収できるとは限らず、正しい商品の再送コストも発生します。これらのミスは、顧客満足度やブランドイメージの低下にもつながるため、未然に防ぐことが重要です。

2. 人手不足

EC市場が拡大し続ける一方、物流現場での人手不足が深刻化しています。特に、物流の2030年問題に注目が集まっています。国土交通省の総合物流施策大綱（2026年度〜2030年度）によると、2030年には国内の輸送能力が約34%不足するとされています。その主な要因のひとつが、少子高齢化に伴う労働人口の減少によるドライバー不足です。

総務省の各国のEC市場の成長率（2024年〜2029年）によると、日本のEC市場成長率は9.36%と予測されています。これは世界平均の9.49%を下回ってはいますが、今後も着実に成長を続ける見通しです。市場が拡大するにもかかわらず人手不足が進めば、配送遅延をはじめとする物流トラブルのリスクが高まります。

さらに、EC物流では繁忙期と閑散期があり、人員の確保や調整の負担があります。もし繁忙期に人的リソースが不足すると、需要があるにもかかわらず商品の供給が追いつかない事態が発生してしまいます。

3. 物流コストの増加

物流コストとは、人件費、輸送・運送費、倉庫の家賃など、物流全般にかかる費用のことです。主なコスト増加の要因は以下の通りです。

人件費：最低賃金の上昇やドライバー不足による人件費の増加
輸送・運送費：燃油サーチャージやガソリン価格の高騰
資材費：円安や物流コスト上昇による物価高

日本ロジスティクスシステム協会（JILS）の2025年度物流コスト調査によると、2024年の売上高に対する物流コストの比率は5.36%で、過去20年間で4番目に高い水準を記録しました。円安の進行や物流の2030年問題を背景に、コストは今後もさらに増加すると予想されており、価格設定や利益率への影響はより深刻になる可能性があります。

4. 短納期による負担

翌日配達をはじめとする短期間での納品サービスにより、現場の負担が増加し、その持続可能性が問われ始めています。急な注文や翌日配達への対応には多くの人手とコストが必要で、倉庫スタッフや配送ドライバーへの負荷が高くなります。こうした負担の増加は離職率の上昇を招き、さらなる人手不足を引き起こすという悪循環に陥るリスクがあります。

理想的には、配送スピードと現場負担のバランスをうまく取ることが必要です。しかし、競合が短納期サービスを提供すると、EC事業者もそれに追随せざるを得ないというのが実情です。

5. 個人情報の取り扱い

EC物流では顧客の個人情報を取り扱うため、万が一流出させてしまうと、損害賠償などの法的責任を問われるだけでなく、社会的信用の失墜にも直結します。さらに、事業規模が大きくなるほど預かる情報量も増えるため、管理が煩雑になるとともに、万が一流出した際の影響も大きくなります。

たとえば、2025年10月にアスクル株式会社がランサムウェア攻撃を受け、運営するECサイトの顧客氏名、メールアドレス、電話番号などの顧客情報約74万件が流出しました。クレジットカード情報を保有しない仕組みにより決済情報の流出は免れたものの、出荷業務の一時停止や個人情報保護委員会を含む関係当局への報告、対象者への謝罪対応を余儀なくされました。

EC物流業務を改善する3つの方法

物流代行サービスを活用する
作業工程を見直す
物流システムやツールを導入する

1. 物流代行サービスを活用する

物流代行サービスを利用することで、業務の負担を減らせるだけでなく、1件あたりの出荷コストも抑えられる場合があります。複数の事業者の荷物をまとめて処理するため、スケールメリットが働くからです。

委託先を選定する際は、システム利用料や配送料だけでなく、以下のような点も確認しておきましょう。

ラッピングやカスタムメッセージカードなどの付加価値サービスへの対応有無
当日・翌日配達といったラストワンマイルの迅速性

また、事業の規模に応じて、複数の業者と契約しておくことも重要です。特定の業者に依存しすぎると、トラブルが発生した際に自社の物流が停止するリスクがあるからです。たとえば、近距離配送に強い業者と長距離配送に強い業者を使い分けるなど、緊急時のバックアップを意識した契約体制を整えましょう。

2. 作業工程を見直す

EC物流の作業工程ひとつひとつの業務改善に取り組みます。まずは各工程を書き出して可視化したり、現場スタッフからの意見を集めたりして、改善できそうな点を洗い出しましょう。主に以下の様な取り組みが検討できます。

新人スタッフや繁忙期採用する臨時スタッフの教育に時間がかかっている場合は、業務のマニュアル化を進める
ミスを防ぐために、入荷から出荷までの各ステップで注意すべき点をチェックリストにする
返品・クレーム対応のばらつきを防ぐために、判断基準を策定してスタッフ間で共有する

各取り組みは、目標を設定して成果を確認し、定期的にプロセスを見直す必要があります。たとえば、月次のクレーム数などを指標として測定します。単に導入するだけでは現場の負担を増やす結果になりかねないため、効果の検証を継続的に行い、運用の改善につなげることが重要です。

3. 物流システムやツールを導入する

システムやツールを活用することで、EC物流の業務を効率化できます。また、属人化やミスを減らす効果も期待できます。主に以下のようなシステムがあります。

WMS（倉庫管理システム）：バーコードなどを用いて入出荷管理・在庫管理を効率化するシステムです。たとえば、棚卸し時はハンディターミナル（専用端末）やスマホでバーコードをスキャンするだけで、実在庫とデータ上の差異が自動算出されます。
OMS（受注管理システム）：受注から出荷までのプロセスを一元管理するシステムです。たとえば、ECモールや自社ECサイトなど複数の販売チャネルからの注文を1つのダッシュボードで管理できるため、注文の漏れや重複を防げます。
ECプラットフォームのアプリ：Shopify（ショッピファイ）などのECプラットフォームが提供するアプリを活用することで、ECサイトと物流システムを連携できます。たとえば、受注データの自動取り込み、宛名ラベルの自動作成、在庫数の自動更新などが可能になります。

システムやツールの導入には初期費用や運用コストが発生します。自社の物流規模や課題に合わせ、段階的に導入を検討しましょう。

EC物流代行サービス3選

Shopifyフルフィルメントネットワーク
オープンロジ
はぴロジ

1. Shopifyフルフィルメントネットワーク

Shopifyフルフィルメントネットワーク（英語）は、Shopify公式のフルフィルメントサービスです。Shopifyアプリ上で、連携する物流代行業者を選び、配送プロセスを管理できます。現在は海外販売としてアメリカでフルフィルメントを行う場合のみ、利用できます。日本の企業も利用可能ですが、在庫をアメリカ国内で用意しておく必要があります。

出典：Shopifyフルフィルメントネットワーク

2. オープンロジ

openlogi（オープンロジ）はECサイトに特化した物流代行サービスです。ShopifyなどのECプラットフォームとオープンロジのシステムをAPI連携することで、受注後の業務を自動化できます。梱包や出荷などを代行してくれるだけでなく、顧客にパーソナライズした商品サンプルやメッセージカードなどの同梱にも対応しています。

料金は、オープンロジ倉庫への商品の保管や出荷数に応じた従量課金制となっています。初期費用と固定費はかかりません。詳しい料金については別途見積もりが必要です。

出典：オープンロジ公式サイト

3. はぴロジ

はぴロジは1996年創業の物流DXサービスです。受注管理・倉庫管理システムの提供や倉庫マッチングのほか、EC向けの物流代行も提供しています。主要なECプラットフォームと連携可能で、サブスクや食品の冷凍発送にも対応しています。

EC事業者の利用料金は、固定費として基本料金15,000円（受注件数500件まで）と、月間受注件数に応じた従量料金が発生します。詳細は料金シミュレーターで確認できます。

出典：はぴロジ公式サイト

EC物流のテクノロジー

AI
ロボティクス
ビッグデータ
IoT

1. AI

AIとは、大量のデータをもとに学習し、パターンを認識して予測や判断を行う技術です。物流分野では、過去の配送実績、季節変動、天候などのデータをAIに学習させることで、最適な配送ルートの設定や在庫補充のタイミングの自動調整が可能になります。

たとえば、ファミリーマートはAIを活用した配送シミュレータを2022年から順次導入し、配送ルートを最適化しています。2024年には、2017年度対比で走行距離を約5,300万キロ（約20%）削減することに成功しています。

2. ロボティクス

ロボットを活用した業務の自動化は、特に大規模な倉庫などにおいて重要な役割を担っています。たとえば、AGV（無人搬送車）やロボットアームによるピッキングや仕分け、ベルトコンベアを使った大量の荷物の運搬など、24時間365日稼働できる自動化システムの導入が進んでいます。

人手不足や人件費の高騰などの事情もあり、ロボティクスの重要性は今後ますます高まると見られています。矢野経済研究所の調査（2025年3月）によると、2024年度の物流ロボティクス国内市場規模は前年度比13.1%増の約404億円が見込まれ、2030年度には1,238億円規模に拡大すると予測されています。

3. ビッグデータ

注文処理、出荷、配送などの工程で生成される大量のデータを分析し、活用することで、物流を効率化できると考えられています。

たとえば、株式会社Hacobu（ハコブ）が発表した物流ビッグデータラボは、参画企業の物流データを共有・分析し、共同輸配送の実現やCO2排出量の削減を目指しています。同社の分析では、1日の運行のうち41.3%で共同輸配送の実現可能性があることが明らかになっています。

4. IoT

IoT（モノのインターネット）は、物理的な設備にセンサーや通信機器を取り付けて、インターネットと接続することを指します。IoTにより、あらゆるデータの収集や分析が可能となります。

物流分野では、商品にRFID（ICタグ）を取り付けることで、倉庫業務の効率化が進められています。RFIDは電波を使って情報をやり取りするため、バーコードのようにスキャナーで読み取る必要がありません。リーダーの前を通過させるだけで、在庫数や商品詳細などの必要な情報がクラウド上へ自動で同期されます。たとえば、佐川グローバルロジスティクスは、RFIDを用いたアパレル向け物流ソリューションを提供しています。